Sin embargo, a pesar de seguir llenando estadios, los largos años de intenso trabajo empezaron a hacer mella en la banda creando constantes rumores de una pronta separación. En 1993 Bruce Dickinson anuncia su partida de la banda. La noticia fue una sorpresa tanto para los fans como para los restantes músicos de la agrupación pues Dickinson puso como excusa estar algo cansado del constante ritmo de trabajo algo que nunca les había comentado. Como parte de las actividades de despedida, se lanzaron tres discos en vivo:   A Real Live One , A Real Dead One y Live At Donington.Una vez finalizada la gira, Bruce anuncia la reactivación de su carrera como solista con su material Balls To Picasso.

La era Blaze

Para 1994, luego de una serie de una extenuante búsqueda y constantes audiciones, Blaze Bayley es anunciado como la nueva voz de la doncella. Bayley, miembro en ese entonces de la agrupación Wolsbane, era un viejo conocido pues había teloneado a Maiden en algunas ocasiones durante sus últimas giras.
Al año siguiente, sale a la venta el primer álbum de esta nueva etapa: The X Factor. Con él se buscó demostrar que Iron Maiden no dependía de Bruce Dickinson para seguir triunfando. El material de tono sombrío, presentaba canciones como Sign of the Cross o Man On The Edge que destacan de los demás temas por su complejidad y producción. Bayley trató de imponer su estilo propio, buscando no ser visto como un simple reemplazo. Sin embargo su voz no se acoplaba muy bien a los temas de los discos anteriores debido a registros de notas un tanto inferiores a las logradas por Bruce.  
A pesar de un aceptable desempeño en ventas, The X Factor no fue muy bien recibido por la legión de fans. Aún así la gira se llevó a cabo cumpliendo con las expectativas de la banda.

Luego de la edición de su primer  recopilatorio titulado The Best of the Beast, la doncella se embarca en la producción del Virtual XI el cual vio la luz finalmente en 1998.  El resultado final no mostró nada nuevo e incluso la falta de química entre Bayley y el resto de los miembros se hizo muy evidente. La reacción de la audiencia no se hizo esperar pues  lo consideraron como una broma de mal gusto e incluso calificándolo como el peor en la historia de Maiden.  Durante muchas presentaciones los espectadores abuchearon el pobre desempeño de Blaze en el escenario. En general éste era cualquier cosa menos lo esperado trayendo como consecuencia fuertes críticas posteriores por parte de sus compañeros que lo llevarían abandonar el grupo durante la gira. Muchos denominaron estos hechos como un fracaso total y por ende vaticinaron el final del camino para Iron Maiden.

Una nueva era

Para 1999, luego de una serie de rumores, se anuncia el regreso de dos viejos conocidos: Bruce Dickinson y Adrian Smith. La noticia  trajo gran alegría a la fanaticada pues con ello la banda regresaba a su alineación más exitosa. Como apoyo a la gira se edita el disco EdHunter, un recopilatorio con veinte temas elegidos por los mismos fans a través de la Internet el cual además incluía como novedad un juego de video con Eddie como personaje principal. La gira comprendió varios lugares de Europa anunciando a todas luces el regreso de una renovada doncella a los escenarios. Al año siguiente se lanza el álbum A Brave New World el cual presentó como gran novedad el trío de guitarristas compuesto por Smith, Gers y Murray. Con esto la banda produjo canciones llenas de una gran fuerza y agresividad musical  cosechando excelentes críticas y una muy buena acogida por parte de la audiencia. Tal fue el éxito del material que Maiden fue llamado a cerrar el festival de Rock In Río en Brasil.  De este concierto se extrae el álbum Rock In Río (2002) el cual daba una vez mas testimonio del fuerte resurgimiento de una de las bandas más emblemáticas del heavy metal. SIGUE>